Pentas Akhir Tahun SDS Kupu-Kupu merupakan acara yang paling ditunggu-tunggu setiap tahunnya karena seluruh siswa akan tampil di Pendopo Waskitaning Budoyo dalam suatu pementasan. Tiap siswa memiliki peran tertentu, seperti aktor, aktris, penari, dan/atau penyanyi dalam acara ini. Acara ini ditonton oleh orang tua siswa dan tamu undangan yang menonton dari amfiteater pendopo. Namun pada tahun ajaran 2020-2021, karena adanya pandemi, Pentas Akhir Tahun yang biasa diadakan di Pendopo Waskitaning Budoyo SDS Kupu-Kupu terpaksa dipindahkan ke dalam bentuk virtual. Walaupun begitu acaranya tidak kalah meriah karena seluruh siswa SDS Kupu-Kupu tetap dapat menunjukkan bakatnya dalam acara virtual ini.
